Le Master « Enseigner les SVT, préparation à l’agrégation » se fait en étroite collaboration avec le Master « MEEF 2nd degré : enseigner les SVT » de l'INSPE et avec le Master " Enseignement et Éducation : Professorat du second degré ".
Ainsi, l’année de M1 est à 80 % mutualisée entre les parcours, ce qui assure une cohérence des enseignements. Les étudiants du M1 « Enseigner les SVT, préparation à l’agrégation » ont ainsi les mêmes formations professionnelles que les étudiants du M1 M2E pour les préparer au métier d’enseignant. Ils effectuent également les mêmes stages en établissement secondaire.
La grande mutualisation de l’année de M1 permet également aux étudiants d’accéder plus facilement à des passerelles entre les parcours. Il est ainsi fréquent que des étudiants de M1 Enseigner les SVT, préparation à l’agrégation postulent ensuite en M2 M2E et inversement. Il est également régulier que des étudiants ayant suivi l’intégralité du Master M2E poursuivent par une année de préparation à l’agrégation en M2.